Fakulta poskytuje komplexní vzdělání v oblasti diagnostiky, terapie a prevence nakažlivých i nenakažlivých nemocí zvířat a základní znalosti v oblasti hygieny potravin živočišného původu.

Magisterský studijní program Veterinární lékařství je šestileté studium (12 semestrů). Celkový objem výuky je 5055 hodin, z toho přednášek 1575 hodin a praktické výuky (cvičení, praxe, stáže na klinikách) 3480 hodin. Jednotlivé semestry trvají 13, resp. 14 týdnů s přibližným rozsahem přímé výuky okolo 30 hodin týdně. Po ukončení semestru následuje zkouškové období, kdy studenti skládají zkoušky z disciplin, jejichž výuka skončila. Během celého studia vykoná student 44 zkoušek. Studium je ukončeno státní rigorózní zkouškou, která se skládá ze 4 povinných dílčích státních rigorózních zkoušek (Choroby psů a koček, Choroby přežvýkavců a prasat, Hygiena potravin a Infekční choroby zvířat a legislativa) a další 1 povinně volitelné dílčí státní rigorózní zkoušky (Choroby koní; Choroby drůbeže a faremně chovaných králíků; Choroby plazů, ptáků a drobných savců; Obhajoba odborné práce). Úspěšným absolventům studia na FVL je udělován titul "doktor veterinární mediciny" (MVDr.).

Bakalářský studijní program Veterinární asistence je tříleté studium (6 semestrů).

Cílem bakalářského studijního programu Veterinární asistence je získání profesně odborných znalostí, praktických zkušeností, dovedností a potřebné úrovně teoretických poznatků tak, aby absolvent byl kvalifikovaným veterinárním asistentem, schopným uplatnit se ve všech druzích veterinárních praxí. Celkový objem výuky je 1 710 hodin, z toho přednášek 508 hodin, 714 hodin praktické výuky (cvičení) a 488 hodin (externí praxe a stáže na klinikách). Jednotlivé semestry trvají 13, resp. 14 týdnů s přibližným rozsahem přímé výuky okolo 22 hodin týdně. Po ukončení semestru následuje zkouškové období, kdy studenti skládají zkoušky. Během celého studia vykoná student 27 zkoušek a na závěr studia 5 státních závěrečných zkoušek (Asistence při vyšetřování zvířat, odběru vzorků a při aplikaci léčiv, Asistence ve veterinární chirurgii, ortopedii a zobrazovací diagnostice, Asistence ve vnitřním veterinárním lékařství, porodnictví a reprodukci zvířat, Infekční choroby zvířat, asistence při aplikaci vakcín a Právní předpisy, management, evidence a administrativa veterinární činnosti). Úspěšným absolventům je vydán diplom s vysvědčením o vykonání státní závěrečné zkoušky a udělen titul „bakalář“ („Bc.“) uváděný před jménem. Na úspěšně ukončené studium bude možné navázat magisterským studiem (Mgr.).